As kekkei genkais incompletas são as implantadas e não as que se nasce. As regras para esse tipo de kekkei genkai são:
1 - Não se Evolui
Se você implantou um sharingan nível 2 em você, ele vai ser nível 2 pra sempre.
2 - Não Desativa
O Sharingan também não desativa se implantado
3 - Gasta um terço do chakra
Um exemplo é Kakashi que não consegue usar os jutsus do mangekyou sharingan 3 vezes. Outro exemplo é Danzou que perdia quase metade do chakra ao usar um jutsu de Mokuton (por ter um braço com células de Hashirama).